Sotto tortura
44min - Uno scheletro parziale viene trovato incassato nel cemento, e Brennan, Booth e tutto il team del Jeffersonian vengono chiamati a indagare. Booth sospetta che la vittima sia stata uccisa da Hugh Kennedy, un membro di una pericolosa famiglia del crimine organizzato. A complicare il suo piano di trovare e arrestare Kennedy c’è la dichiarazione di una cacciatrice di teste, che afferma di aver visto morire Kennedy bruciato vivo nell’esplosione di un’auto, ma i fatti non tornano per Booth, che cerca di stanarlo. Ma quando Booth va a caccia di Kennedy, il piano non va come previsto, e Kennedy rapisce Booth, costringendo Brennan a trovare Booth prima che faccia la stessa fine della prima vittima. Intanto, mentre è in visita a sua madre al cimitero, Brennan riceve una visita a sorpresa da suo padre Max (guest star Ryan O'Neal), che cerca di dirle ciò che sa sulla madre defunta. Brennan non vuole dare spago a quel criminale di suo padre e non esita a chiamare la polizia, ma Max se ne va prima del loro arrivo. Max si fa vivo di nuovo al suo appartamento, e ancora una volta non riesce a farsi ascoltare prima che lei chiami di nuovo la polizia, ma la reazione di Brennan fa sperare a Max di aver fatto un po’ breccia nei suoi confronti. Dopo la scomparsa di Booth, Brennan chiede a suo padre, che ha molta esperienza nell’eludere le forze dell’ordine, di aiutarla a trovare Booth. Mentre la vita di Booth e di suo figlio sono in pericolo a causa di informazioni che lui ha sul caso, Brennan e suo padre formano una insolita squadra per salvare Booth prima che sia troppo tardi.